Alex君等の論文が、Sci Rep誌に採択されました。

Alex君、難波君等の下記論文が、Scientific Reports誌に採択されました。

Extracellular DNA of slow growers of mycobacteria and its contribution to biofilm formation and drug tolerance.

Aleksandr Ilinov, Akihito Nishiyama, Hiroki Namba, Yukari Fukushima, Hayato Takihara, Chie Nakajima, Anna Savitskaya, Yuri Vinnik, Gebremichal Gebretsadik, Mariko Hakamata, Yuriko Ozeki, Yoshitaka Tateishi, Shujiro Okuda, Yasuhiko Suzuki, & Sohkichi Matsumoto

抗酸菌は、速育菌と遅発育菌に分類されますが、後者は、結核菌やMAC症の起因菌など、病原性菌が多いことが知られています。本論文では、FACS解析により、遅発育性の抗酸菌が細胞外にDNAを有していることを見いだし（一方で速育抗酸菌では、ほぼ認められない）、それがペリクル型のバイオフィルム形成や抗菌薬耐性に関わることを示しました。さらに染色体DNAと菌体外DNAの次世代シーケンサー解析により、結核菌やM. intracellurareでは、ゲノムと同一配列の菌体外DNAが、M. aviumでは、ゲノムDNAに加えてファージDNAが菌体外に蓄積していることを発見しました。

2021年4月、新人7名が加入しました。

例年よりサクラの開花が早かった令和3年4月、

北原知樹さん、山崎智也さん、五十嵐美波さん、萩野公香さん、遠藤明伸さんが修士課程に

長田秀和さんが博士課程に加わりました。

また、研究支援員として目黒佳未さんが加わりました。

入学・入局おめでとう。

昨今、感染症研究の重要性が高まっています。がんばりましょう。

立石等の論文が、BMC Microbiol誌に採択されました。

立石善隆等の論文が、BMC Microbiol誌に採択されました。

非結核性抗酸菌（NTM）症の主要病原体であるものの、ゲノム解析が進んでいなかった、Mycobacterium intracellulareとその近縁種について、総計55株の次世代シーケンサー解析に基づく、詳細なゲノム解析を行いました。その結果、M. paraintracellulare, M. indicus pranii and M. yonogonense は独立種というよりも、M. intracellulareの亜種であること明確にし、提言するに至りました。

Tateishi, Y., Y. Ozeki, A. Nishiyama, M. Miki, R. Maekura, Y. Fukushima, C. Nakajima, Y. Suzuki, and S. Matsumoto. 2021. Comparative genomic analysis of Mycobacterium intracellulare: Implications for clinical taxonomic classification in pulmonary Mycobact

袴田真理子さん「卒業」と「学長賞」おめでとう。

袴田真理子さん（呼吸器・感染症内科学）が、ヒトに感染した北京型結核菌のゲノム変異解析に関する成果で、学位を取得しました。本研究成果は、日本結核・非結核性抗酸菌症学会賞など、多数の賞をいただきましたが、最後に、新潟大学学長賞にも選ばれました。

今後も益々の活躍が期待されます。

https://www.med.niigata-u.ac.jp/contents/info/news_topics/140_index.html

https://www.nature.com/articles/s41598-020-75028-2

3名が医学研究賞を獲得、みかんの会

快挙！　2020年10月15日に開催された｢みかんの会｣（新潟大学医学部医学科大学院生の研究発表会）にて当教室の学生3名が医学研究賞を獲得し表彰されました。

井内さん、修士一年での優秀賞｢すごい｣ですねー。

新潟大学若手医学研究賞

1. 結核診断に有用な抗原の検討および発現時期の観察

井内　絵梨奈　修士課程1年

2. A molecule regulates metabolism ensuring the survival of Mycobacterium tuberculosis var. BCG

Shaban Amina Kaboso　博士課程1年

3. ゲノム編集技術を用いた、結核菌分子の機能解析

袴田　真理子　博士課程4年

袴田が、Young Award優秀賞をいただきました。

　2020年10月11〜12日、Web開催にておこなわれた、第95回日本結核・非結核性抗酸菌症学会総会にて、袴田真理子が、｢早期発症者と長期潜伏後発症者より分離した結核菌北京株のゲノム変異解析｣について発表し、｢若手の医師・医療従事者・研究者のご発表の中から選抜される優秀演題｣として、Young Award優秀賞を受賞しました。おめでとうございます。

閉会式・表彰式の模様

https://www.kekkaku.gr.jp/jst95/portalsite.html

袴田、瀧原、岩本、田丸等の論文が、Sci Rep誌に採択されました。

2020年10月、袴田、瀧原、岩本、田丸等の論文が、Scientific Reports誌に採択されました。

｢Higher genome mutation rates of Beijing lineage of Mycobacterium tuberculosis during human infection ｣

Mariko Hakamata, Hayato Takihara, Tomotada Iwamoto, Aki Tamaru, Atsushi Hashimoto, Takahiro Tanaka, Shaban A. Kaboso, Gebremichal Gebretsadik, Aleksandr Ilinov, Akira Yokoyama, Yuriko Ozeki, Akihito Nishiyama, Yoshitaka Tateishi, Hiroshi Moro, Toshiaki Kikuchi, Shujiro Okuda, and Sohkichi Matsumoto

　世界に拡散した結核菌は７系統に分類でき、その中でLinage 2に属する北京型結核菌は東アジアに多く、ヨーロッパに多いLinage 4と並んで、病原性が高いことが知られています。一方、結核菌の進化速度は、病原細菌のなかで極めて緩慢で、ゲノムあたりおよそ0.1塩基/年ほどの変異率でしかないと言われていました。

　本研究では、本邦で生じた“北京型結核菌株による、あるアウトブレーク”から、複数の人に感染しそれぞれ異なる期間を経て発症に至った菌株のゲノム解析を行った結果、他の系統よりおよそ10倍高い変異率であったことを報告しました。また早期発症者由来株では、変異率が高く、長期潜伏菌においては低いものの、酸化ストレス依存的な変異が多いことも分かりました。

　およそ10年間におよぶ追跡により、本研究ははじめて、人に感染し発症せしめた結核菌北京株のゲノム変化を解析した結果、他の結核菌系統よりも変異率が高く、それが、北京型結核菌の高い適応性や薬剤耐性率の要因である可能性を示しました。

COVID19ワクチン開発を行います。

　長期間の免疫刺激が可能で、強いアジュバント活性（免疫賦活活性）がありながら、安全で実績のある、結核ワクチンBCGを用いたCOVID19ワクチン開発を行います。

https://www.niigata-u.ac.jp/news/2020/73341/

BCGは、結核以外の呼吸器感染症などにも効果があり1、COVID19への効果も期待されています2, 3。

1, https://www.cell.com/cell/pdf/S0092-8674(20)31139-9.pdf

2, https://www.pnas.org/content/117/30/17720

3, https://www.nature.com/articles/s41577-020-0337-y

8月28日-29日、合同学会開催

　2020年8月28日-29日、第３４回日本バイオフィルム学会学術集会、第５７回日本細菌学会中部支部総会の合同学会を、コロナ禍を鑑み、完全オンラインーリアルタイムで開催いたしました。延べ162名の参加を得てトラブルもなく、またオンラインのメリットも活かされて、充実した会を開催することができたと思います。

　講演賜りました先生方、参加いただきました方々、協賛いただきました企業・病院様に感謝です。

プレスリリース2本

1, TNseqを用いてMycobacterium intracellulareの必須遺伝子を初めて同定し、プレスリリースを行いました。

https://www.med.niigata-u.ac.jp/contents/info/news_topics/126_index.html

2, 結核の新薬、デラマニドが、NADとのアダクトを形成することを初めて明らかにし、それが抗菌活性に関わることを示し、プレスリリースを行いました。

https://www.med.niigata-u.ac.jp/contents/info/news_topics/128_index.html

春、人事異動　2020年

　客員研究員の横山晃先生（東京大学呼吸器内科へ）とテクニシャンの小林悠さん（旦那さんの移動により）が共に東京に移動しました。

　一方、井内絵梨奈さんが大学院修士課程に、竹石惇樹君が大学院博士課程に入学、小林悠さんの後任に伊藤祐子さんが赴任しました。

コロナ禍で歓送迎会を催せなかったのは残念です。

新型コロナウイルス感染症、COVID-19と結核ワクチンBCG

　結核ワクチンBCGの接種をとりやめた国のCOVID-19発症者は、死亡率が高い、つまり｢COVID-19の重症化とBCG接種は、逆相関する｣、と指摘されています。一部の国ではBCG接種効果の治験が始まりました（下記事）。

Can a century-old TB vaccine steel the immune system against the n ew coronavirus?　Mar. 23, 2020, Science.

Could BCG be used to protect against COVID-19? Redelman-Sidi G, Nat Rev Urol. 2020 Apr 27

COVID-19: A model correlating BCG vaccination to protection from mortality implicates trained immunity

Cameron M. Green, Stephanie Fanucchi, Jorge Dominguez-Andres, , Ezio T. Fok, Simone J.C.F.M. Moorlag4, Yutaka Negishi, Leo A. B. Joosten, Mihai G. Netea & Musa M. Mhlanga

Mandated Bacillus Calmette-Guérin (BCG) vaccination predicts flattened curves for the

spread of COVID-19 Martha K. Berg, Qinggang Yu, Cristina E. Salvador, Irene Melani, Shinobu Kitayama

Differential COVID-19-attributable mortality and BCG vaccine use in countries

Anita Shet1, MD PhD*, Debashree Ray, PhD, Neelika Malavige2, MBBS PhD, Mathuram Santosham1, MD

Is BCG vaccination causally related to reduced COVID‐19 mortality?

Masayuki Miyasaka

EMBO Mol Med (2020)12:e12661

SARS-CoV-2 Rates in BCG-Vaccinated and Unvaccinated Young Adults

Uri Hamiel, MD1; Eran Kozer, MD1; Ilan Youngster, MD, MMSc1

JAMA. 2020;323(22):2340-2341.

BCG vaccine protection from severe coronavirus disease 2019 (COVID-19)

Luis E. Escobar, Alvaro Molina-Cruz, and Carolina Barillas-Mury

PNAS, July 9, 2020

　BCG（正式名、Mycobacterium tuberculosis var. BCG、旧 Mycobacterium bovis BCG）は、結核菌の弱毒株で、接種後しばらく人体に持続感染する生ワクチンとして接種されます。BCGの接種や20億人に及んでいる結核菌の無症候感染自体が、人の免疫系を活性化し、抗酸菌症以外の病気に対しても何らかの抵抗性を付与して、接種者の健康や、古くは人類の生き残りに関わってきた可能性も想像されます。

　実際にBCGは、膀胱癌の再発防止に明かな効果があり、またツベルクリン反応（結核菌に対する細胞性免疫応答）陽性とアトピーの逆相関も報告されています。

　慎重な検証が求められますが、BCG接種がCOVID-19に本当に有効ならば、BCGの利用検討や、何故か？を明らかにする必要があります（松本記）。